É esse o termo que eu usaria para traduzir Moscheegemeinde.

Em primeiro lugar, vale lembrar que Moscheegemeinde é uma nome ocidental para uma coisa não-ocidental. Então, já é um nome estranho por si só e, mais que isso, é uma tentativa de "tradução" dessa coisa para um outro universo, o das comunidades religiosas católicas e evangélicas: Pfarrgemeinde etc.

Mas uma mesquita tem conotações bem diferentes das de uma comunidade católica ou evangélica. A começar pelo status político: Moscheegemeinde é termo leigo para Moscheeverein, que na Alemanha de forma alguma equivale ao peso de uma "Kirche(ngemeinde)", que goza de privilégios estatais.
Ver muitos detalhes interessantes sobre isso aqui:
http://de.wikipedia.org/wiki/Moscheegemeinde

Em segundo lugar, "congregação" pode até soar uma tentativa de tradução para outro universo etc., mas os próprios islamitas usam essa palavra em um dos sentidos gerais definidos pelo Houaiss:
"1 reunião, assembléia, grupo de pessoas
1.3 Rubrica: religião.
assembléia de fiéis"

(Nas faculdades federais brasileiras, por exemplo, "congregação" também é usado como assembléia.)

Veja exemplos do uso de "congregação" pelos próprios islamitas (brasileiros):

"A Mesquita é um lugar sagrado para os muçulmanos, é onde os muçulmanos se ***congregam*** para realizar as suas orações diárias.
(...)
As Mesquitas são verdadeiramente as casas de Deus na terra para ***congregar*** os homens a fim de cumprirem os preceitos divinos da oração. É o local aonde os muçulmanos se congregam para realizar as suas orações diárias e para as orações de Sexta-feira.
(...)
O muçulmano não deve perder em nenhuma ocasião de orar ***em congregação***, cada vez que tal ocasião se apresentar. A oração em congregação é uma brilhante demonstração da unidade de objetivo e ação, da piedade e humildade coletiva perante Deus, e solidariedade afetiva entre muçulmanos.
A ***congregação islâmica*** nas Mesquitas é uma resposta positiva aos problemas mais urgentes da humanidade, causados pela discriminação racial, os conflitos sociais e os preconceitos humanos."
http://www.islambr.com.br/mesquita.htm

Acho que "congregação" só, sem "mesquita" ou "islâmica" para acompanhar, seria uma boa tradução quando o contexto já deixa claro de que se trata de comunidade em torno de uma mesquita. (Tantas vezes pegamos palavras alemãs que são redundantes ou excessivamente minuciosas, mas que na tradução perdem alguns "quilinhos".) Mas, se preferir, "congregação islâmica" estaria de bom tamanho, embora corra o risco de confusão com a Congregação Islâmica, no sentido de comunidade de islamitas de todo um país ou toda uma região.

Boa sorte!