Environmental DNA (eDNA) metabarcoding assays

French translation: analyses de méta-codes a barres d\'ADN environnemental) (ADNe)

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English term or phrase:Environmental DNA (eDNA) metabarcoding assays
French translation:analyses de méta-codes a barres d\'ADN environnemental) (ADNe)
Entered by: Jean-Rémy Émorine

18:29 Sep 28, 2019
English to French translations [PRO]
Science - Environment & Ecology / Dectection of endangered species
English term or phrase: Environmental DNA (eDNA) metabarcoding assays
Development and validation of an avian environmental DNA (eDNA) metabarcoding assay for detection of Least Bittern (Ixobrychus exilis) in aquatic ecosystems.

Other example:

Describing and monitoring biodiversity comprise integral parts of ecosystem management. Recent research coupling metabarcoding and environmental DNA (eDNA) demonstrate that these methods can serve as important tools for surveying biodiversity, while significantly decreasing the time, expense and resources spent on traditional survey methods. The literature emphasizes the importance of genetic marker development, as the markers dictate the applicability, sensitivity and resolution ability of an eDNA assay. The present study developed two metabarcoding eDNA assays using the mtDNA 16S RNA gene with Illumina MiSeq platform to detect invertebrate fauna in the Laurentian Great Lakes and surrounding waterways, with a focus for use on invasive bivalve and gastropod species monitoring. We employed careful primer design and in vitro testing with mock communities to assess ability of the markers to amplify and sequence targeted species DNA, while retaining rank abundance information. In our mock communities, read abundances reflected the initial input abundance, with regressions having significant slopes (p
Jean-Rémy Émorine
Canada
Local time: 18:38
analyses de méta-codes a barres d'ADN environnemental) (ADNe)
Explanation:
Explanation:
"Fish community assessment with eDNA metabarcoding ...
https://go.gale.com › i.do
by NT Evans - ‎2017 - ‎Cited by 37 - ‎Related articles
Les meta-codes a barres d'ADN environnemental) (ADNe) constituent un autre outil qui permet d'inferer la richesse specifique en recueillant et en sequencant ...


"Traces d'espèces insaisissables recherchées dans l'ADN sanglant ...
https://fr.yair-technologies.com › traces-elusive-species-s...
Malgré tout, dit-il, les évaluations de l'ADN environnemental se sont bien ... qualifient les études de l'ADN environnementales de «méta-codes à barres», car ..."

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Note added at 16 hrs (2019-09-29 11:21:40 GMT)
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premier lien : https://tinyurl.com/ADNenvironnemental

second lien : https://preview.tinyurl.com/ADNenvironnement2

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Note added at 16 hrs (2019-09-29 11:26:30 GMT)
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"Les chercheurs qualifient les études de l'ADN environnementales de «méta-codes à barres», car elles reposent sur des codes à barres d'ADN: de courtes séquences d'ADN identifiant de manière unique une espèce. Le codage par barres permet de distinguer deux espèces de papillons, par exemple, en séquençant seulement une partie d'un gène. Mais une grande partie de l'ADN récupéré à partir de sources environnementales telles que le sol ou les matières fécales a été déchiqueté en brins courts et les bases de données de codes à barres existantes ont tendance à contenir les segments plus longs identifiés par les anciennes technologies de séquençage de l'ADN. La plupart des séquenceurs actuels peuvent lire des segments d'ADN plus courts que la longueur d'un code à barres. "C'est dommage que nous ne puissions pas utiliser tout ce qui a été développé", a déclaré Taberlet."
https://fr.yair-technologies.com/traces-elusive-species-soug...
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Belgium
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4analyses de méta-codes a barres d'ADN environnemental) (ADNe)
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environmental dna (edna) metabarcoding assays
analyses de méta-codes a barres d'ADN environnemental) (ADNe)


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"Fish community assessment with eDNA metabarcoding ...
https://go.gale.com › i.do
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Les meta-codes a barres d'ADN environnemental) (ADNe) constituent un autre outil qui permet d'inferer la richesse specifique en recueillant et en sequencant ...


"Traces d'espèces insaisissables recherchées dans l'ADN sanglant ...
https://fr.yair-technologies.com › traces-elusive-species-s...
Malgré tout, dit-il, les évaluations de l'ADN environnemental se sont bien ... qualifient les études de l'ADN environnementales de «méta-codes à barres», car ..."

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premier lien : https://tinyurl.com/ADNenvironnemental

second lien : https://preview.tinyurl.com/ADNenvironnement2

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"Les chercheurs qualifient les études de l'ADN environnementales de «méta-codes à barres», car elles reposent sur des codes à barres d'ADN: de courtes séquences d'ADN identifiant de manière unique une espèce. Le codage par barres permet de distinguer deux espèces de papillons, par exemple, en séquençant seulement une partie d'un gène. Mais une grande partie de l'ADN récupéré à partir de sources environnementales telles que le sol ou les matières fécales a été déchiqueté en brins courts et les bases de données de codes à barres existantes ont tendance à contenir les segments plus longs identifiés par les anciennes technologies de séquençage de l'ADN. La plupart des séquenceurs actuels peuvent lire des segments d'ADN plus courts que la longueur d'un code à barres. "C'est dommage que nous ne puissions pas utiliser tout ce qui a été développé", a déclaré Taberlet."
https://fr.yair-technologies.com/traces-elusive-species-soug...

FX Fraipont (X)
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Asker: Bonjour, Le premier lien ne fonctionne pas et je ne trouve pas la référence justificative dans le second.

Asker: Merci!

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